1、糞便污染
　　目前畜禽養殖產生了大量糞便，畜禽糞便中含有大量氮、磷和有機污染物等。由于以往畜禽養殖場（戶）環境意識差，畜禽糞便隨意堆放，并隨雨水進入水系。因此，畜禽糞便成為繼工業污染、生活污水垃圾污染之后的第三大污染源，是造成農村環境污染的主要原因。
　　2、水質污染
　　畜禽養殖場排出的污水，嚴重污染地下水。高濃度的污水排入河中，造成水質不斷惡化。污水對周邊農民的生產生活帶來極大影響，有些已對集中飲用水源地構成嚴重威脅。
　　3、大氣污染
　　畜禽糞便經過發酵后會產生大量的氨氮、硫化氫、糞臭素、甲烷等有害氣體，這些氣體不但會破壞生態，而且還會直接影響人類健康。在畜禽養殖過程中，由于對糞便處置不當，相當部分養殖場周圍緊靠公路、村莊，設置的糞場散發出非常難聞的氣味，嚴重影響了周邊居民的生產生活，老百姓苦不堪言，過往行人怨聲載道，養殖戶自己也深受其害。
　　畜禽糞便是規模養殖場重要的污染源，畜禽糞便處理的好壞，不僅關系到養殖場所的衛生，更重要的是由于大量蚊蠅孳生，病原體的擴散，往往導致疫病發生率上升。因此，畜禽糞便的處理是畜禽健康養殖十分重要的一環。
　　解決糞便的污染：
　?。?）首先畜禽規模養殖場必須建有對畜禽糞便、廢水和其他固體廢棄物進行綜合利用的化糞池沉淀池等設施，圈舍內設置有處理畜禽糞污、排污的通道和設施，為此福滿堂機械設備有限公司專門研發了一系列的處理糞便污染的設備，例如干濕分離機，發酵床工藝，翻耙機等。
　?。?）要對養殖規模較小的養殖場，要結合新農村建設、實行“三改”有效解決畜禽糞便的污染。對于無“三改”條件的養殖戶應有與養殖規模相適應的糞便堆積處，以便對畜禽糞便進行堆積發酵，以殺滅糞便中的細菌、病毒、寄生蟲卵及其他病原體，以保持良好的衛生環境。